工程施工企业的纳税人如果在外地有工程项目的，需要在项目当地预缴增值税及附加税，个人所得税等，一般个人所得税的预缴有两种方式，一种是直接按收入核定，另外一种是企业自行申报，对于按收入核定的企业，仍然需要在当地申报，而对于自行申报的企业，已经申报过的员工，则不用再次申报。