其他应付款社保代扣有余额，需要去查明是什么原因导致的。如果是从个人工资扣除了个人社保部分还没有缴纳导致的有余额，缴纳了之后就没有余额了。如果是因为账务处理错误导致的其他应付款社保代扣有余额，那就需要冲销错误的账务处理，然后做一笔正确的账务处理就是了。