小规模纳税人企业所得税汇算清缴的流程是：根据单位利润表和明细账，填写所得税汇算清缴申报表的附表的账载金额栏次，然后根据税法规定填写相应的税收金额栏次，差额做纳税调整处理，然后填写所得税汇算清缴申报表的主表数据，审核无误之后，就可以提交申报了。