企业个税被申诉后，需要准备与该自然人有关的资料，去税务局提供说明。一般是2种：

1、如果该自然人确实是属于本公司员工，则提供该员工的工资表及发放工资的单据，比如银行付款单，或者现金支出单，如果有购买社保之类的，也可以提供作为佐证。

2、如果该自然人不是公司员工，则需要调整申诉年度企业的利润，补缴该年度的企业所得税。