企业资本公积和盈余公积的主要区别如下：
1. 概念不同。资本公积是企业收到投资者出资额超出其在注册资本所占份额的部分，以及其他资本公积等。盈余公积是指企业按照有关规定从净利润中提取的积累资金。
2. 分类情况不同。盈余公积包括法定盈余公积和任意盈余公积。资本公积包括资本溢价和其他资本公积等。
3. 主要用途不同。盈余公积的用途是弥补亏损、转增资本、分配股利。资本公积的用途主要是转增资本，即增加实收资本。
4. 计算方法不相同。资本公积=实收资本 留存收益×（欲占注册资本比例-已占注册资本比例）。法定盈余公积按当年净利润计提，不是按营业利润，也不是按利润总额计提：法定盈余公积=当年净利润*10%。
5. 主要作用不同。盈余公积用来办理包括提现和发放员工工资福利等在内一切符合法律法规的结算。资本公积主要是用来存钱、取钱、转账的公司账户。
此外，关于资本公积转增资本是否需要缴纳印花税的问题，根据《**税务总局关于资金账簿印花税问题的通知》（国税[1994]25号），资本公积转为实收资本时，“实收资本"与“资本公积”的合计金额并未增加，因此不需要缴纳印花税。