公司支付的证书费计入到财务费用—服务费科目。银行开户交纳的工本费，根据财税〔2016〕36号附件1中金融服务注释，属于直接收费金融服务，可以取得增值税专用发票，并按规定抵扣进项税额。其对应的分录为，

借：财务费用—服务费/工本费

应交税费—应交增值税—进项税额，

贷：银行存款/现金等。