企业应该按实际发生的业务的金额来开具发票和计入对应的账目，如果实际开票金额比做账金额多的时候，需要根据情况来确认具体的处理方式，如果是实际开票金额多了，则应该作废或者冲红错误的发票，然后开具正确的金额的发票，如果是做账的金额少了，则应该冲减错误的账务处理，然后按正确的金额入账。