对方公司支付的预付账款，对于本公司来说，应该计入到预收账款科目进行核算，在实际业务发生时，再从冲减预付账款的金额，其对应的分录为，

借：银行存款，

贷：预收账款。

当企业确认收入时，做如下分录，

借：预收账款，

贷：主营业务收入。