企业支付的航天开票服务费，根据税务机关规定，全额减免增值税，所以其会计分录如下：

1、企业办税人员支付航天开票服务费时：

借：管理费用，

贷：银行存款。

2、根据政策规定，在进行实际申报抵减增值税应纳税额时，其分录为：

借：应交税费—应交增值税—减免税额，

贷：管理费用。